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寻找生命之树上的枝干
滑铁卢大学的Lila Kari说:“据我们所知，这是第一个使用深度神经网络对未标记DNA序列进行无监督聚类的无对齐方法。”
资料来源:滑铁卢大学切里顿计算机科学学院
深度学习无监督DNA序列聚类(DeLUCS)技术由加拿大滑铁卢大学和西部大学的研究人员开发，通过无监督机器学习绘制生物体之间的分类关系。
滑铁卢大学的里拉·卡里说，DeLUCS确定了“从脊椎动物、细菌和病毒等不同生物的一系列遗传数据集中”的这些关系。
研究人员使用频率混沌游戏表示(FCGR)比较了生物体的基因组，FCGR是DNA中碱基序列的图形描述，显示特定核苷酸序列出现的频率。
该过程生成FCGR序列对，并将其作为人工神经网络的输入，“从中发现可用于创建集群的模式，”Kari说。“这种方法的准确率接近80%，而且通常要好得多。”
从滑铁卢大学切里顿计算机科学学院(加拿大)
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