在整个海德堡奖得主论坛会议着重强调了跨学科研究在未来计算中可能发挥的作用。这是讲座的重点,比如斯蒂芬·斯梅尔的粉笔对话以及理查德·卡普的鼓舞人心的演讲科学上的计算透镜“由于我刚刚开始我的职业生涯,并希望在计算和生物医学研究的交叉领域进行研究,我很高兴看到这种类型的工作被频繁提及,作为该领域的一个关键未来方向。
先说一点背景知识,我一直对研究领域之间的交叉感兴趣。我在杜克大学完成了计算机科学和物理的本科学位,同时花了很多时间在约瑟夫·奈文斯的组在分子遗传学和微生物学系在读研究生之前,我主要在IBM的生命科学应用团队工作,负责蓝色基因超级计算机。为了更深入地参与大规模并行系统的研究,我开始了在哈佛大学的研究生学习,并加入了Efthimios Kaxiras的多尺度建模小组.在哈佛大学,我完成了计算机科学的硕士学位和应用物理学的博士学位,并辅修了计算科学。几周前,我开始在劳伦斯利弗莫尔国家实验室做劳伦斯研究员。我的研究目标之一是扩展血液动力学模型我和卡希拉斯教授一起研究癌症转移的潜在机制。为此,我正在与Franziska Michor在波士顿达纳·法伯癌症研究所工作。到目前为止,能够从事这种跨学科工作一直是我做出的每一个职业决定的重要因素。在这个过程中,我很幸运有支持我的导师和合作者。当我开始我的博士后工作时,我敏锐地意识到我是多么幸运,我可以自由地设定我的研究目标,而且这只是一个为期三年的职位。考虑下一步会引发一些问题,比如我适合哪个部门。这项研究会刊载在《计算机科学》杂志上吗?应用物理吗?生物医学工程?即使是现在,我发现有时很难确定我应该在哪个社区发布内容,也很难让我觉得自己属于哪个社区。
听到许多诺贝尔奖得主开始将他们的兴趣转向将数学和计算方法应用于生物学等学科,这是令人鼓舞和欣慰的。在年轻研究人员访问邻近机构的过程中,跨学科工作背后的兴奋进一步加深。我参观了科学计算跨学科中心(IWR)惊讶地发现它成立于1987年。我们听取了几位研究人员的意见,从老挝瓷砖的研究到人类步态的建模,再到海水吸收碳的研究。每个项目都吸引了来自数学、化学、计算机科学和生物学等多个学科的合作者,以制定可以通过模拟辅助的深入研究问题。创始总监Willi Jäger解释说,有一个实验的组成部分是追求一个项目的必要要求。结果是,许多研究生花了部分时间在不同的实验室。与我目前的情况类似,有一些专注于计算的研究生花时间与癌症研究人员和医生直接共事。项目的范围和合作伙伴的多样性给我留下了深刻的印象。我发现,与实验工作有密切的联系,以补充我的建模研究是创建具有实际影响的模拟的关键。T他的课程设置强调需要在一个明确的领域建立专业知识,然后补充赞扬。这被描述为75比25。我特别喜欢小组之间的互动,以及每个项目中潜在的计算技能可能相似的认识。我发现我在血流建模、无线网络建模和分子对接等领域所做的工作有很多相似之处。我很欣赏与我们交谈的学生和研究人员对他们感兴趣的领域之外正在进行的其他项目的了解。
在过去的几年里,美国对应用计算中心的需求不断增长,并出现了致力于这一使命的新兴机构和部门。虽然在美国有一些长期存在的例子,但像IWR这样的研究所是创建他们所描述的“拥有高性能并行计算机的跨学科智库……”的很好的例子。
在参观IWR、桂冠演讲和与与会者的讨论之间,我兴奋地离开HLF,看到了研究的进展,也回到了工作中。与多位诺贝尔奖得主讨论了他们对利用自己的专业知识和研究生物学问题的兴趣,这让我兴奋地看到了他们的进步。让这些领域最优秀的人才转向神经生物学等领域,应该会产生令人着迷的结果。不仅如此,与我交谈过的许多年轻研究人员正在转向研究传统学科边界内的问题。如果有什么不同的话,看起来这些领域将会有令人兴奋的贡献和发现,因为许多年轻的研究人员和获奖者将转向跨学科研究。
阿曼达反是劳伦斯利弗莫尔国家实验室的劳伦斯研究员。
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